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有关基因测序的口号

时间:2016-05-23 18:01

谈谈基因测序技术经历了哪几个发展阶段,这些技术的特点分别是什么

基序也称DNA测序现物学研究中重要的手段之一。

基因测序技术经三个发展阶段。

第一代DNA测序技术是1975年由桑格(Sanger)和考尔森(Coulson)提出的链终止法。

第一代技术准确率高,读取长,是至今唯一可以进行“从头至尾”测序的方法,但存在成本高、速度慢等方面的不足,并不是最理想的测序方法。

使用第一代Sanger测序技术完成的人类基因组计划,花费了30亿美元巨资,用了十三年的时间。

随后的二、三代测序技术以高通量为共同特征,也被称为“新一代测序技术(NGS)”。

Roche公司的454测序平台、Illumina公司的Solexa测序系统以及ABI公司的SOLID测序系统标志着第二代测序技术诞生。

尽管各系统在高通量水平、测序准确度、存储格式、技术方法上各有差异,但共同特征是大大降低了测序成本并极大地提高了测序速度,完成一个人的基因组测序只需一周左右时间。

然而第二代测序技术在测序前要通过PCR段对待测片段进行扩增,增加了测序的错误率。

而且二代测序产生的测序结果长度较短,需要对测序结果进行人工拼接,因此比较适合于对已知序列的基因组进行重新测序,而在对全新的基因组进行测序时还需要结合第一代测序技术。

近期出现的Helicos公司的Heliscope单分子测序仪、Pacific Biosciences公司的SMRT技术、Oxford Nanopore Technologies公司正在研究的纳米孔单分子技术,被认为是第三代测序技术。

与前两代技术相比,其最大的特点是单分子测序。

第三代测序技术解决了错误率的问题,通过增加荧光的信号强度及提高仪器的灵敏度等方法,使测序不再需要PCR扩增这个环节,实现了单分子测序并继承了高通量测序的优点。

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人类基因组的测序是怎么进行的

求测序的方法及步骤

如果楼主指的是人因组计划,那时方法叫做双脱氧终止法,也叫做sanger法。

它的原理是DNA合成过程中,DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸)来作为原料,但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。

具体实验是通过PCR来完成的,但与普通PCR不同,它只需要一个引物而不是一对。

在4个相同的反应体系中分别加入普通的dNTP以及4种不同的ddNTP(比如体系1里面缺少dATP,而有ddATP,以此类推)。

假设四个体系中分别加入的是ddATP, ddGTP, ddCTP和ddGTP我们就分别把这个叫做A,G,C,T体系,然后每个体系中,会在遇到相应碱基的时候停止反应,这样就产生了一系列长度不一并且分别在以A,G,C,T时终止的DNA片段,比如A体系中的DNA片段,都是以A结尾的DNA 。

接着我们拿着这些片段去进行一个高分辨率的电泳(能够区分出一个碱基的差别),然后根据电泳结果,我们就能读出序列了。

最早的测序方法就是这样,但是这种方法极其费时间,它需要首先将DNA打断成无数合适的小片段,然后再在完成测序后将其拼接起来。

这就是为什么当时人类基因组计划需要那么多国家合作并且耗费那么多时间的原因。

当然,现代的第二代DNA测序技术已经普及了,它们相比第一代测序技术而言,具有低成本,高通量,短耗时等优点。

如果用第二代DNA测序技术去完成人类基因组测序的话,现在最多也就耗时一个月左右。

基因测序与基因检测的区别

测序是测出DNA上的是A,C,G,T中的哪一个;而基因检测过杂交或测序等方法来DNA序列中是否含有特定的一段序列,来明确相关的基因某些功能。

比如耳聋基因检测就是用芯片来检测一个正常人是否携带隐性先天性耳聋基因或者药敏性耳聋基因。

测序只是得到DNA的序列,而检测是最终要跟功能建立联系。

个人基因组测序有哪些意义

关于NCBI的使用 分享一篇文章:一、 进入NCBI主页: 在search后面选择Gene,在for后面填写需要查找的基因的名字。

如图所示:screen.width-333)this.width=screen.width-333 align=absMiddle border=1> 点击“Go”,出现以下界面:出现了很多基因序列,在每个序列的右边还有“Order cDNA clone” 的链接,这些序列中有些序列是跟你的目的基因同名的,有些是别名(Other Aliases)与你的目的基因一致,根据每个序列的介绍认真选择你的目的基因。

上图中我需要的IL6是标号为2的序列。

二、查找cDNA、mRNA和蛋白序列 1. 查找cDNA序列 ① 点击Order cDNA clone, 出现目的页面如图所示:screen.width-333)this.width=screen.width-333 align=absMiddle border=1> ② 点击Clone Sequence后面的链接即可得到cDNA序列。

点击后如图所示(只抓取其中一部分):screen.width-333)this.width=screen.width-333 align=absMiddle border=1>2. 查找mRNA、蛋白序列 回到步骤1点击“Go”之后出现的页面,点击目的基因的名字,出现以下页面(只抓取相关部分):页面的下半部分,即可以获取mRNA和蛋白序列的部分:找到“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”,它分为几个板块,第一个“mRNA and Protein”区可以让我们找到连续的编码mRNA序列和蛋白序列。

在mRNA and Protein下面有两个序列代码(中间划有一个箭头),这代表了mRNA序列和蛋白序列。

分别点击就可以得到相应的序列页面。

点击后如图所示,mRNA序列:蛋白序列如下:screen.width-333)this.width=screen.width-333 align=absMiddle border=1>NCBI Reference Sequences (RefSeq)的第二个板块是Reference assembly,它下面显示的是Genomic ,点击Genomic下面Reference assembly对应的Genbank或FASTA即可出现编码的DNA序列(注意:只是编码序列,其中包括内含子,但一般没有5‘非编码区)。

这样我们就可以找到基因的cDNA序列、连续的编码mRNA序列、蛋白序列以及含有内含子的编码DNA序列了。

自己去看一下吧,看完了记得请我吃饭哦,呵呵

NGS基因测序技术是什么

做全基因组测序可以检测出人体4100多种单基因遗传病以及所有常见疾病风险,通过全基因组测序可以指导人们正确精准使用药物;可以结合个人体质与特质基因采用正确的生活方式和保健方式;可以针对自身存在的健康隐患采取个性化的预防措施,可以指导人们的健康,生活,教育,精准治疗等等。

还可以检测出人体23对染色体,2.5万基因编码,30亿碱基对,精准率高达99.99%;对于个人来讲,全基因组测序,就是每个人都必须拥有的生命全息说明书。

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